周星驰自导自演的【少林足球】及【功夫】风靡全日本，日本观众可说是对星爷的“少林功夫”非常着迷，特别邀请周星驰亲自监制首部进军日本的国际大片【少林少女】，请来演技出众的当红女星柴崎幸、型男江口洋介上阵，苦练少林功夫，并加入子弟兵张雨绮及笑弹林子聪、田启文，且由热爱中国功夫、曾执导过【大搜查线】的知名导演本广克行掌舵，破天荒中、港、日合作携手打造动作喜剧【少林少女】，必令观众们耳目一新。)

故事是描述樱泽 凛 (柴崎幸饰)是一名极具武术天份的少女，自幼被送往中国少林寺学习少林拳，更矢志回日本将少林拳发扬光大。然而回到日本，凛却惊见她爷爷所创立的道场已经荒废，同门师兄弟也各散东西，而师父岩井拳见 (江口洋介饰)更转行改当中华料理厨师，并叫凛放弃少林拳。凛大受打击，却不肯言弃，决心一边自行重建道场，一边找寻机会叫人来学少林拳。

敏敏 (张雨绮 饰)、铁布三 (田启文 饰)及水尚飘 (林子聪 饰) 三人同于岩井工作的中华餐馆打工，敏敏对凛特别好奇，见她对少林拳满腔热诚，便将凛带进国际星馆大学的袋球队打球，希望可以凭其身手提升球队的实力，而凛亦因此进入国际星馆大学就读。可惜凛一开始空有一身好武功，却忽略了团队合作的重要性，更因为太过着重于个人功夫的技巧而令球队于比赛中败阵。幸而透过师父岩井及敏敏的提醒及鼓励，凛终于明白到团队合作的重要，更明白要将少林拳发扬光大并不光是叫人习拳，而是要将少林拳的精神融入生活，从而吸引其他人对武术的兴趣。重新振作的凛再次融入球队，更同时影响其他队员也一起练习少林拳，各人的球技因而大大跃进！

正当一切事情都看似顺利时，道场及餐馆却突然被一班神秘人袭击，岩井被打成重伤，敏敏更被绑架带走！而凛此时发现原来一连串的袭击都是由星馆大学的校长大场雄一郎 (仲村彻饰)指使，他更是十多年前使道场毁于一旦的凶手！为了救回敏敏，以及挽回道场及少林拳的尊严，凛决定以少林功夫只身挑战大场雄一郎，更激发起她自己一直都没有发现的潜藏能量…….一场惊世的武术大战即将在大荧幕爆发！